Pour entreprendre une action durable et concertée à l'échelle de la Suisse, la commission s'est structurée différemment. Des groupes régionaux sont créés de manière à laisser aux spéléologues la gestion effective de « leur coin ». La coordination est assurée par 6 séances annuelles des responsables de ces groupes (bureau de la commission).
Le bureau est l'organe décisionnel. D'un côté il coordonne les activités des groupes régionaux, de l'autre, il supervise les actions du président de la commission et de l'ISSKA. Ce dernier joue un rôle de secrétariat général, c'est-à-dire qu'il exécute le gros du travail administratif et la mise en application des décisions du bureau de la commission. Il soutient directement les groupes régionaux, en particulier sur le plan scientifique.

Exemple d'activité

Un rapport d'activités assez détaillé est paru sur le site Internet de la SSS. L'assainissement de la Baume des Détritus (VD) est un exemple typique d'activité de la commission. En juin 2002, le canton de Vaud, les autorités communales et le groupe patrimoine Vaud ont organisé une action de dépollution afin d'évaluer, en vue d'autres opérations de ce genre dans le futur, l'investissement (temps et finances) lié à une telle action, ainsi que les retombées sur la population. Au début, l'accueil des autorités communales était emprunt de méfiance et d'étonnement. Au fil des entretiens, les responsables communaux ont apprécié notre attitude constructive et non accusatrice. Au final, l'opération a réuni près d'une quarantaine de personnes (les autorités de la commune, des agriculteurs, des membres des sociétés locales, le responsable cantonal des décharges et les spéléos). Dans une ambiance très sympathique, chacun s'est engagé avec entrain pour redonner au site son aspect originel. Près de 15 m3 de déchets ont été évacués et, les villageois ont apprécié de voir le représentant de l'Etat lui-même retrousser ses manches.

Et pour conclure

Chaque spéléo se doit de contribuer à la conservation du milieu souterrain en participant aux activités du groupe régional de sa région. C'est en unissant nos efforts que nous parviendrons à améliorer l'état de nos grottes et à voir peu à peu disparaître les « poubelles naturelles » de nos pâturages et à préserver le traits caractéristiques du paysage karstique.